Ngày 10/5/2019, Chi cục HQCK Móng Cái và Hiệp hội Doanh nghiệp TP Móng Cái đã ký kết Biên bản ghi nhớ về việc phối hợp giữa 2 đơn vị trong việc phát triển quan hệ đối tác hải quan - doanh nghiệp, nhằm phát huy hiệu quả việc trao đổi ý kiến, thực hiện giải pháp hỗ trợ, tháo gỡ những khó khăn vướng mắc trong thực hiện nhiệm vụ của mỗi đơn vị, góp phần cải thiện môi trường đầu tư kinh doanh, nâng cao năng lực cạnh tranh cấp tỉnh và nâng cao năng lực cạnh tranh cấp sở, ngành, địa phương.
Qua 3 năm triển khai, Chi cục đã kịp thời thông tin, tuyên truyền tới Hiệp hội các cơ chế, chính sách, quy định pháp luật và các thông tin có liên quan, như: Luật Hải quan; Luật Thuế xuất khẩu, thuế nhập khẩu; các nghị định, thông tư hướng dẫn trên nhiều kênh thông tin, như niêm yết tại nơi làm thủ tục hải quan, đăng tải trên Fanpage CDCI Hải quan Móng Cái, website Hải quan Quảng Ninh.
Tại các địa điểm làm thủ tục hải quan đã niêm yết đầy đủ 119 thủ tục hành chính thuộc thẩm quyền giải quyết cấp chi cục để doanh nghiệp tra cứu thuận lợi. Từ tháng 5/2019 đến nay Chi cục đã đăng tải trên các kênh thông tin 132 lượt tin bài, văn bản về các cơ chế, chính sách, quy định của pháp luật tới cộng đồng doanh nghiệp nói chung, thành viên Hiệp hội Doanh nghiệp TP Móng Cái nói riêng.
Chi cục duy trì hội nghị đối thoại doanh nghiệp, để lắng nghe, kết nối, tháo gỡ, đồng hành cùng doanh nghiệp. Trong 3 năm qua, dù chịu ảnh hưởng của dịch Covid-19, Chi cục đã tổ chức 11 hội nghị đối thoại với doanh nghiệp tại trụ sở Chi cục, qua đó giải đáp 28 lượt vướng mắc ngay tại hội nghị. Đối với các vướng mắc vượt thẩm quyền, Chi cục kịp thời báo cáo Cục Hải quan tỉnh, UBND TP Móng Cái… để kiến nghị, giải quyết.
Trong quá trình thực hiện thủ tục hải quan hằng ngày, Chi cục chỉ đạo các đội, tổ công tác, CBCC đơn vị lắng nghe, giải đáp các vướng mắc về thủ tục hải quan, hỗ trợ phân loại hàng hóa XNK cho các doanh nghiệp để giúp việc thông quan nhanh chóng, thuận tiện. Từ tháng 5/2019 đến nay, Chi cục đã hướng dẫn qua email cho trên 2.500 lượt doanh nghiệp, hướng dẫn trực tiếp cho trên 200 lượt doanh nghiệp về nghiệp vụ phân loại hàng hóa XNK; hướng dẫn gần 100 lượt doanh nghiệp về trình tự thủ tục thực hiện đối với các nghiệp vụ, các thủ tục hành chính trong lĩnh vực hải quan.
Song song với đó, hoạt động cải cách hành chính tại Chi cục được đẩy mạnh toàn diện với 6 nội dung (cải cách thể chế; cải cách thủ tục; cải cách tổ chức bộ máy; cải cách chế độ công vụ; cải cách tài chính công; xây dựng chính phủ điện tử, chính phủ số). Chi cục thành lập 4 tổ công tác để phân mảng hỗ trợ đồng hành cùng doanh nghiệp. Các tổ công tác đã tiến hành 80 lượt tiếp xúc với các doanh nghiệp tại trụ sở Chi cục, trụ sở doanh nghiệp để lắng nghe các khó khăn vướng mắc, hướng dẫn giải quyết.
Chi cục bố trí công chức trực 24/7, đảm bảo giải quyết ngay các lô hàng làm thủ tục XNK. Trong 3 năm qua, Chi cục thường xuyên, kịp thời báo cáo Cục Hải quan tỉnh gửi Công hàm cho Hải quan Trung Quốc tạo thuận lợi cho hoạt động XNK, góp phần đẩy nhanh tiến độ thông quan hàng hóa. Gần đây nhất là cơ quan hải quan phối hợp với các lực lượng chức năng tại Cửa khẩu triển khai phương án "vùng xanh an toàn", khôi phục thông quan tại Cửa khẩu Móng Cái sau gần 2 tháng tạm dừng do dịch Covid-19.
8 tháng năm 2022, Chi cục làm thủ tục cho 21.505 tờ khai với tổng kim ngạch hàng hóa XNK 2.100,04 triệu USD (xuất khẩu 937,44 triệu USD; nhập khẩu 1.162,6 triệu USD); tổng số 614 doanh nghiệp làm thủ tục, tăng 3 doanh nghiệp so với cùng kỳ năm trước; số thu NSNN đạt 974,56 tỷ đồng, tăng 54,9% so với cùng kỳ năm 2021, đạt 74,11% chỉ tiêu kế hoạch năm...
Thực hiện quy chế phối hợp giữa 2 đơn vị đã góp phần tạo môi trường bình đẳng, lành mạnh trong hoạt động thương mại, XNK của doanh nghiệp, nâng cao chất lượng hoạt động của cơ quan hải quan, từng bước chuyển đổi cơ chế quản lý sang phục vụ và cung cấp dịch vụ, thúc đẩy mối quan hệ đối tác hải quan - doanh nghiệp ngày càng đi vào chiều sâu.